Workshop Meta_Microbial 2024

O workshop Meta_Microbial tem como objetivo fornecer aos investigadores académicos, estudantes e bolseiros uma visão geral das ferramentas actuais para analisar dados de sequências de nova geração e fazer uma interpretação perspicaz para os campos da ecologia microbiana e da microbiologia ambiental. Será um curso de curta duração (3 dias) com palestras, discussões de artigos, exemplos práticos e duas sessões paralelas “hands-on”. O workshop será ministrado presencialmente na Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP) de 4 a 6 de setembro de 2024.

Coordenação: Miguel Semedo, Investigador de Pós-Doutoramento no CIIMAR (msemedo@ciimar.up.pt) Catarina Magalhães Líder de Grupo no CIIMAR (cmagalhaes@ciimar.up.pt).

Instrutores:

• Adriana Rego. Investigadora de Pós-Doutoramento no CIIMAR. ORCID: 0000-0001-9647-1197.
• Francisco Pascoal. Estudante de doutoramento no CIIMAR e na FCUP. ORCID: 0000-0003-2315-358X.
• Miguel Semedo. Investigador de Pós-Doutoramento no CIIMAR. ORCID: 0000-0003-2263-2212.
• Nicola Gambardella. Bolseiro de investigação do CIIMAR. ORCID: 0000-0002-4343-332X.
• Catarina Magalhães. Team Leader at CIIMAR. ORCID: 0000-0001-9576-2398.
• Leandro Pereira. Investigador do CIIMAR. ORCID: 0000-0002-2311-7469.

Organização: Leonor Pizarro e Rúben Pereira (comissão de alunos de doutoramento do CIIMAR), Adriana Rego, Catarina Magalhães, Francisco Pascoal, Miguel Semedo, Nicola Gambardella.

CONTEÚDO (Programa completo disponível aqui)

• Introdução. Tecnologias de sequenciação. Geração de dados.
• Ferramentas R e Python para estudos de ecologia microbiana na “Era Ómica”.
• Metabarcoding/Metagenómica dirigida. Diversidade, taxonomia e inferência funcional.
• Metagenómica não direccionada (sequenciação do genoma completo) e interpretações funcionais.
• Exploração de recursos e repositórios em linha.
• Ferramentas estatísticas e de análise de dados alternativas para explorar o reino microbiano.
• Outros conhecimentos sobre visualização e análise de dados.

PÚBLICO-ALVO (número estimado de participantes: 25 – 50)

Estudantes de pós-graduação, investigadores académicos e outros membros da comunidade de investigação interessados em ecologia microbiana, microbiologia ambiental, metabarcoding e metagenómica.

Taxa de inscrição: 100 euros. Serão concedidas cinco a dez isenções de taxa de inscrição a estudantes seleccionados que não disponham de fundos específicos para apoiar a participação e/ou a membros da Sociedade Portuguesa de Ecologia (SPECO). Os pedidos de isenção estão disponíveis no formulário de inscrição. Os detalhes do pagamento da taxa serão fornecidos por correio eletrónico a cada participante após a notificação de aceitação.

Requisitos: Computador portátil próprio com o R e o RStudio instalados (serão fornecidas orientações de instalação, se necessário). Alguma experiência com linguagens de programação, como R ou Python, seria benéfica, mas não é um requisito.

COMO SE INSCREVER
Preencher o formulário de inscrição até 31 de julho.