O objetivo global do AtlantOS é conseguir uma transição de um conjunto de atividades de observação oceânica livremente coordenadas, produzindo dados fragmentados, frequentemente monodisciplinares, para um Sistema Integrado de Observação do Oceano Atlântico (IAOOS) sustentável, eficiente e apto para o efeito.

Isto será conseguido através de atividades de investigação e inovação centradas em: definir requisitos e concepção de sistemas, melhorar a prontidão da observação de redes e sistemas de dados, envolver as partes interessadas em torno do Atlântico, bem como reforçar a contribuição da Europa para o Sistema Global de Observação dos Oceanos (GOOS), uma componente importante do Grupo de Observação da Terra (GEO), o seu Sistema Global de Sistemas de Observação da Terra (GEOSS), e especificamente no seu emergente “Oceanos e Sociedade”: Iniciativa “Planeta Azul”. AtlantOS contribui para o crescimento azul ao fundir novas necessidades de informação relevantes para setores-chave como os transportes, turismo, pescas, biotecnologia marinha, extração de recursos e energia com as necessidades existentes. A AtlantOS contribui significativamente para a cooperação transatlântica ao integrar as atividades de observação existentes estabelecidas pelos países europeus, norte-americanos e sul-americanos, e africanos, e ao preencher as lacunas existentes para alcançar um IAOOS ágil e flexível e sistemas de informação oceânica associados em torno do Atlântico.