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Grupo de investigação

Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade

Biotecnologia Marinha

Equipa de investigação: Biorremediação e Microrganismos para a Sustentabilidade
A equipa de Biorremediação e Microrganismos para a Sustentabilidade (BMS) explora a relação entre microrganismos e poluentes, visando o desenvolvimento de tecnologias de biorremediação para recuperação de ecossistemas e sustentabilidade ambiental.

Além disso, temos estudado as associações microrganismos-planta para o desenvolvimento de soluções baseadas na natureza para a gestão da água, e as interações microrganismos-animal para aumentar a sustentabilidade ambiental da aquacultura.
Temos estado envolvidos em vários projetos regionais, nacionais e internacionais, onde exploramos as comunidades microbianas naturais, para desenvolver tecnologias de biorremediação para recuperar ambientes marinhos e aquáticos contaminados com diferentes poluentes, incluindo persistentes (por exemplo, hidrocarbonetos de petróleo, metais) e emergentes (por exemplo, contaminantes farmacêuticos, nanopartículas, microplásticos) e também contaminantes biológicos (patógenos e resistência a antibióticos). Aproveitamos a elevada diversidade microbiana natural selecionando amostras de diferentes ambientes (por exemplo, rios, estuários, zona costeira, mar profundo) para identificar, caracterizar e isolar microrganismos capazes de metabolizar diferentes poluentes. Todos estes microrganismos isolados estão a ser criopreservados numa biblioteca georreferenciada, que faz parte da Coleção de Culturas Microbianas do CIIMAR (CM2C – cm2c.ciimar.up.pt ), para futuras aplicações.
Além disso, temos estudado as associações de plantas e microrganismos para promover o uso de zonas húmidas naturais e construídas como soluções baseadas na natureza (SNB) para reduzir a entrada de contaminantes nos ambientes aquáticos. Estas SBN estão a ser exploradas para remover poluentes (por exemplo, nutrientes, metais, hidrocarbonetos, micropoluentes orgânicos) de diferentes tipos de água/águas residuais (por exemplo, águas de riachos e marinas e águas residuais de aquacultura e suinicultura).
Além disso, estamos a desenvolver soluções baseadas em microbiomas para promover a sustentabilidade da aquacultura, diminuindo o impacto ambiental da produção e aumentando o bem-estar dos peixes. Isto inclui a otimização do tratamento biológico para aumentar a qualidade da água e o desenvolvimento de alternativas terapêuticas aos antibióticos para o controlo de surtos de agentes patogénicos, a fim de reduzir a entrada de contaminação química e biológica no ambiente.
Globalmente, o nosso trabalho está alinhado com o Plano de Acção para Poluição Zero da UE e com a Missão da UE Restaurar os nossos Oceanos e Águas. Além disso, nosso trabalho traz contribuições importantes para os ODS, principalmente para o ODS14 (Vida Marinha) e ODS6 (Água Potável e Saneamento).

Investigador principal

Group Leader

Ana Paula Mucha é licenciada em Ciências Aquáticas (1993), mestre em Ecologia, Gestão e Modelação de Recursos Aquáticos (1997) e doutorada em Ciências Aquáticas (2002). Tem um cargo de investigadora no CIIMAR, Universidade do Porto, Portugal, sendo membro da Direção e Investigadora Principal da Equipa ECOBIOTEC (Bioremediação e Funcionamento de Ecossistemas).

Além disso, é Professora Auxiliar Convidada no Departamento de Biologia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto. Centra sua investigação na relação entre microrganismos e contaminantes, visando o desenvolvimento de tecnologias de biorremediação para recuperação de ecossistemas e sustentabilidade ambiental. Ela também explora as associações micróbio-planta para o desenvolvimento de soluções baseadas na natureza para a gestão da água e as interações micróbio-animal para aumentar a sustentabilidade ambiental da produção aquícola.

Ela é autora de ca. 90 artigos SCI, incluindo revistas de alto perfil na área de Ciências Marinhas e Ambientais. Ela esteve envolvida em vários projetos regionais, nacionais e internacionais, e atualmente coordena a participação do CIIMAR no projeto europeu “BIOSYSMO – BIOremediation Systems explorando SYnergieS para melhorar a remoção de Mixed pollutants” (GAP-101060211), o projeto “Ocean3R – Reduzir pressões, restaurar e regenerar o oceano e as águas do noroeste de Portugal” (NORTE-01-0145-FEDER-000064), e a Linha de Investigação 4 (Biobancos marinhos como ferramentas para biotecnologia marinha) no programa estruturado de I&D “ATLANTIDA – Plataforma de monitorização do Oceano Atlântico Norte e ferramentas para a exploração sustentável de os recursos marinhos” (NORTE-01-0145-FEDER-000040). Além disso, tem estado envolvida como orientadora em vários programas de mestrado e doutoramento nacionais e europeus, e atualmente co-coordena a equipa da FCUP responsável pelo M2ex-European Joint Doctorate “Exploiting metal-microbe application to expand the circular economy” (< em>União Europeia; programa de investigação e inovação Horizonte 2020 ao abrigo do acordo de subvenção Marie Sklodowska-Curie n.º 861088).

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade

Projetos de investigação

ACTINODEEPSEA

ALGAVALOR

AntiBacFilm

ATLANTIDA

Biological producers of Natural Fluorinated Compounds

BIOMETORE

BIOREM

BIOSYSMO

BLUEandGREEN

BLUEFORESTING

CONNECT2OCEANS

CORAL

FEEDMI

GENiuSAMPLER

INNOVMAR

MAR2PROTECT

MarinEye

MarInfo

MIDFun

MYTAG

NANOSED

NetTag

NETTAGPlus

NITROLIMIT

Ocean3R

OCEANLAB

PBA

PERMAMERC

RASORGMAT

ROSM

SpilLess

Membros do Grupo

PhD student

Margarida Pereira é uma estudante de doutoramento (FCUP-UP) que desenvolve a sua investigação em fitorremediação assistida por microrganismos para a remoção de poluentes mistos em ambiente estuarino, estreitamente alinhada com o Projeto BIOSYSMO do CIIMAR. O seu percurso académico compreende uma Licenciatura em Biologia Celular e Molecular (FCT-NOVA), um Mestrado em Comunicação de Ciência (FCSH-NOVA) e um Mestrado em Biotecnologia para a Sustentabilidade (ITQB-NOVA). Tem experiência em biotecnologia aplicada dos ramos azul, verde e vermelho em variados centros de investigação Portugueses.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
Química ambiental e remediação
Group Leader

Ana Paula Mucha é licenciada em Ciências Aquáticas (1993), mestre em Ecologia, Gestão e Modelação de Recursos Aquáticos (1997) e doutorada em Ciências Aquáticas (2002). Tem um cargo de investigadora no CIIMAR, Universidade do Porto, Portugal, sendo membro da Direção e Investigadora Principal da Equipa ECOBIOTEC (Bioremediação e Funcionamento de Ecossistemas).

Além disso, é Professora Auxiliar Convidada no Departamento de Biologia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto. Centra sua investigação na relação entre microrganismos e contaminantes, visando o desenvolvimento de tecnologias de biorremediação para recuperação de ecossistemas e sustentabilidade ambiental. Ela também explora as associações micróbio-planta para o desenvolvimento de soluções baseadas na natureza para a gestão da água e as interações micróbio-animal para aumentar a sustentabilidade ambiental da produção aquícola.

Ela é autora de ca. 90 artigos SCI, incluindo revistas de alto perfil na área de Ciências Marinhas e Ambientais. Ela esteve envolvida em vários projetos regionais, nacionais e internacionais, e atualmente coordena a participação do CIIMAR no projeto europeu “BIOSYSMO – BIOremediation Systems explorando SYnergieS para melhorar a remoção de Mixed pollutants” (GAP-101060211), o projeto “Ocean3R – Reduzir pressões, restaurar e regenerar o oceano e as águas do noroeste de Portugal” (NORTE-01-0145-FEDER-000064), e a Linha de Investigação 4 (Biobancos marinhos como ferramentas para biotecnologia marinha) no programa estruturado de I&D “ATLANTIDA – Plataforma de monitorização do Oceano Atlântico Norte e ferramentas para a exploração sustentável de os recursos marinhos” (NORTE-01-0145-FEDER-000040). Além disso, tem estado envolvida como orientadora em vários programas de mestrado e doutoramento nacionais e europeus, e atualmente co-coordena a equipa da FCUP responsável pelo M2ex-European Joint Doctorate “Exploiting metal-microbe application to expand the circular economy” (< em>União Europeia; programa de investigação e inovação Horizonte 2020 ao abrigo do acordo de subvenção Marie Sklodowska-Curie n.º 861088).

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
PhD student

Inês Leal é licenciada em Biologia pela Universidade do Porto (FCUP) (2020) e mestre em Biologia Molecular e Microbiana pela Universidade do Algarve (2022). Trabalhou como bolseira de investigação no CCMAR-Algarve durante dois anos num projeto entre Portugal e Angola. Atualmente é aluna de doutoramento na FCUP e irá realizar o seu projeto no CIIMAR e Águas e Energia do Porto. O seu trabalho é focado em soluções de biorremediação para a remoção de micropoluentes emergentes em tratamentos de águas residuais.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
Serviços administrativos
Biobank

Joana P. Fernandes é licenciada (2012) e mestre (2014) em Ciências e Tecnologia do Ambiente (FCUP-UP) e doutorada em Ciências Biomédicas (ICBAS – UP, 2021). Nos últimos anos, ela tem focado a sua investigação na biodegradação de poluentes emergentes por microrganismos autóctones, usando diferentes abordagens para remover estes compostos de ambientes contaminados. Além disso, ela tem estudado como estas estratégias de remediação podem alterar a dinâmica e a estrutura da comunidade natural. Ademais, ela está envolvida no desenvolvimento de uma nova coleção de culturas, trabalhando no isolamento, cultivo e identificação de microrganismos (bactérias e fungos) com diferentes propósitos biotecnológicos.

Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
Investigador

Maria Antónia Salgado concluded her degree in Sciences of the Aquatic Environment at the University of Porto in 1985, joined the Chemistry Department of Abel Salazar Biomedical Institute in 1987, as a lecturer. She got a PhD from the University College of North Wales, UK in 1996. At present she is Assistentr Professor and teaches Physical Chemistry and Environmental Chemistry for undergraduate students and Chemical Analytical Techniques to post-graduate students. She supervised MSc and PhD students, and was the principal investigator in research projects and collaborated in others. Her main research interests are: sustainable aquaculture, analytical chemistry, pollution biomonitoring, aquatic toxicology and coastal management. She is also responsible for physico-chemical water quality analyses for aquaculture companies.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
Técnico de Investigação

A Maria Luis Bôto obteve o grau de licenciada em Biologia em 2016 pela Universidade de Aveiro e o grau de mestre em Biodiversidade, Genética e Evolução em 2018 pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP). Em 2020, começou o doutoramento no Programa Doutoral em Ciências do Meio Aquático – Biologia e Ecologia (ICBAS-UP). A sua investigação irá focar-se na exploração do potencial genético de consórcios microbianos nativos para degradar compostos de petróleo.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
Estudante de Mestrado
EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
PhD student

Rafaela Perdigão é licenciada em Biologia (2015, FCUP) e mestre em Toxicologia e Contaminação Ambientais (2017, ICBAS), pela Universidade do Porto. Atualmente, é aluna de doutoramento no CIIMAR/ICBAS, onde explora a biodegradação de petróleo, combustíveis marítimos e outros poluentes associados a portos, como é o caso dos plásticos, usando microorganismos marinhos.
Ela tem experiência e conhecimento na área de bioremediação autóctone de hidrocarbonetos, em especial, na otimização de consórcios bacterianos para aplicação em ambiente marinho. Os seus principais interesses de investigação incluem a recuperação de ambientes marinhos poluídos, a biotecnologia e a otimização de processos de degradação.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade
Química ambiental e remediação
Estudante de Mestrado
EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biorremediação e microrganismos para a sustentabilidade

Principais publicações

Removing chemical and biological pollutants from swine wastewater through constructed wetlands aiming reclaimed water reuse

Bôto ML, Dias SM, Crespo RD, Mucha AP, Almeida CMR

2023Journal of Environmental Management 326:116642.
Microbial community dynamics in a hatchery recirculating aquaculture system (RAS) of sole (Solea senegalensis)

Bastos Almeida D, Magalhães C, Sousa Z, Borges MT, Silva E, Blanquet I, Mucha AP

2021Aquaculture, Volume 539,736592.
Harnessing the Potential of Native Microbial Communities for Bioremediation of Oil Spills in the Iberian Peninsula NW Coast

Bôto ML, Magalhães C, Perdigão R, Alexandrino DAM, Fernandes JP, Bernabeu AM, Ramos S, Carvalho MF, Semedo M, LaRoche J, Almeida CMR, Mucha AP.

2021Frontiers in Microbiology 12:879.
Pharmaceutical Compounds in Aquatic Environments—Occurrence, Fate and Bioremediation Prospective

Fernandes, J.P.; Almeida, C.M.R.; Salgado, M.A.; Carvalho, M.F.; Mucha, A.P.

2021Toxics 2021, 9, 257.
SARS-CoV-2 RNA detected in urban wastewater from Porto, Portugal: Method optimization and continuous 25-week monitoring

Tomasino MP, Semedo M, Vieira e Moreira P, Ferraz E, Rocha A, Carvalho MF, Magalhães C, Mucha AP.

2021Science of The Total Environment 792:148467.
Diversity and Hydrocarbon-Degrading Potential of Deep-Sea Microbial Community from the Mid-Atlantic Ridge, South of the Azores (North Atlantic Ocean)

Tomasino, M.P.; Aparício, M.; Ribeiro, I.; Santos, F.; Caetano, M.; Almeida, C.M.R.; Carvalho, M.d.F.; Mucha, A.P.

2021Microorganisms, 9, 2389.
Potential of bacterial consortia obtained from different environments for bioremediation of paroxetine and bezafibrate

Fernandes J.P., Duarte P., Almeida C.M.R., Carvalho M.F., Mucha A.P.

2020Journal of Environmental Chemical Engineering, 8: 103881