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Grupo de investigação

Biodegradação e Bioprospecção Microbiana

Biotecnologia Marinha

A equipa de Biodegradação e Bioprospecção Microbiana está interessada em investigar os processos de biodegradação de poluentes ambientais orgânicos, especialmente de compostos fluorados. Com este objetivo, a equipa está focada na obtenção e caracterização de consórcios microbianos capazes de degradar eficientemente esses compostos e na investigação dos mecanismos metabólicos responsáveis pelos processos de biodegradação, gerando conhecimento essencial para o tratamento de efluentes industriais contaminados.

Outro foco importante da equipa é a bioprospecção de actinobactérias marinhas para a descoberta de novos compostos bioativos com aplicações farmacêuticas/industriais. O potencial das actinobactérias para a produção de metabolitos bioativos é enorme e as actinobactérias associadas a fontes marinhas portuguesas são altamente inexploradas. Assim, a equipa está interessada em encontrar novos compostos antimicrobianos, anticancerígenos, anti-inflamatórios e antiobesidade, bem como novos biossurfactantes e outras moléculas industrialmente relevantes. Através da investigação de compostos relevantes para os setores industrial e da saúde, a equipa procura traduzir a investigação biotecnológica em produtos de elevado valor acrescentado e contribuir para o desenvolvimento da economia azul.

Investigador principal

Group Leader

Maria de Fátima Carvalho é licenciada em Microbiologia e doutorada em Biotecnologia pela Universidade Católica Portuguesa. Atualmente é investigadora principal no CIIMAR, onde lidera a equipa de investigação Biodegradação e Bioprospeção Microbiana. Os seus interesses de investigação centram-se em duas linhas principais (i) desenvolvimento de estratégias biotecnológicas para a remoção de poluentes ambientais orgânicos, com especial ênfase em compostos fluorados e (ii) bioprospeção de actinobactérias de diversas fontes (de ambientes terrestres a marinhos) para a descoberta de novas moléculas com aplicações biotecnológicas relevantes.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana

Projetos de investigação

ACTINODEEPSEA

ATLANTIDA

Biological producers of Natural Fluorinated Compounds

BIOREM

BIOSYSMO

BLUEandGREEN

CORAL

INNOVMAR

MAR2PROTECT

MarinEye

NetTag

NETTAGPlus

Ocean3R

PBA

ROSM

SAFE

SpilLess

Membros do Grupo

Estudante de Mestrado
EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Investigador

Diogo A. M. Alexandrino é investigador no CIIMAR e Professor Adjunto Convidado no Departamento de Saúde Ambiental da Escola Superior de Saúde (Instituto Politécnico do Porto). A sua investigação foca-se, primordialmente, no estudo da fisiologia e metabolismo da degradação bacteriana de poluentes (poli)fluorados. Adicionalmente, Diogo também foca a sua investigação no aproveitamento de processos bacterianos para controlo de poluição, para mitigar pressões antropogénicas ou para melhorar a circularidade de diversos resíduos, com recurso a bactérias axénicas, consórcios bacterianos ou através da combinação de reações catabólicas com processos sintéticos.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Estudante de Mestrado

Francisca Oliveira é licenciada em Biologia pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto. Atualmente, encontra-se a frequentar o Mestrado em Biologia Celular e Molecular e a realizar um estágio no CIIMAR com o apoio de uma bolsa BYT+ e incluída na equipa de investigação “Microbial Biodegradation and Bioprospection”.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Técnico de Investigação

A Gabriela Alves Moreira é licenciada em Biotecnologia Medicinal pelo Instituto Politécnico do Porto (2018) e mestre em Genética Molecular pela Universidade do Minho (2021). Após um estágio de licenciatura no BBE, realizou a sua dissertação de mestrado com uma bolsa do programa BYT Plus na descoberta de novos produtos de cianobactérias com bioatividade, no CNP, onde posteriormente teve uma bolsa de investigação no projeto HALVERSITY. Atualmente a Gabriela é técnica da LEGE-CC, trabalhando na manutenção da coleção e na identificação molecular de novas estirpes, e professora assistente convidada na Escola Superior de Saúde do Instituto Politécnico do Porto.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Serviços administrativos
Biobank

Inês Ribeiro é licenciada em Saúde Ambiental (2015), mestre em Toxicologia e Contaminação Ambiental (2017) e doutorada em Ciências Biomédicas (2023). O seu trabalho incide na área da biotecnologia marinha, com foco na bioprospecção de actinobactérias marinhas para descoberta de novos produtos naturais. Atualmente é investigadora (técnica superior de microbiologia) no CIIMAR, no âmbito do Pacto de Inovação, e presta apoio técnico à manutenção e organização de culturas de procariotas não fotossintéticas que irão integrar o Biobanco Azul Português. Possui experiência em isolamento e identificação microbiana, realização de testes de bioatividade e biodegradação, e conhecimento da química de compostos naturais.

Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Estudante de Mestrado
EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Group Leader

Maria de Fátima Carvalho é licenciada em Microbiologia e doutorada em Biotecnologia pela Universidade Católica Portuguesa. Atualmente é investigadora principal no CIIMAR, onde lidera a equipa de investigação Biodegradação e Bioprospeção Microbiana. Os seus interesses de investigação centram-se em duas linhas principais (i) desenvolvimento de estratégias biotecnológicas para a remoção de poluentes ambientais orgânicos, com especial ênfase em compostos fluorados e (ii) bioprospeção de actinobactérias de diversas fontes (de ambientes terrestres a marinhos) para a descoberta de novas moléculas com aplicações biotecnológicas relevantes.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Técnico de Investigação

A Mariana Girão é uma aluna de Doutoramento, atualmente a frequentar o programa de Doutoramento em Ciências Biomédicas do Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar da Universidade do Porto. O seu trabalho de investigação é focado na bioprospecção da diversidade e metabolismo secundário de Actinobactérias de origem marinha, com o objetivo de descobrir novos produtos naturais com aplicações farmacêuticas e industriais. A Mariana possui uma licenciatura em Ciências do Meio Aquático (2016, ICBAS-UP) e um mestrado em Biologia Celular e Molecular (2018, FCUP).

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
PhD student

A Mariana Oliveira é licenciada em Biologia pelo Instituto Superior de Agronomia (Universidade de Lisboa) e mestre em Biologia Humana e Ambiente da Faculdade de Ciências (Universidade de Lisboa). Ela começou a trabalhar no CIIMAR-UP em 2019 no isolamento e identificação de fungos produtores de toxinas. Em 2021, a Mariana granhou uma bolsa de doutoramento da FCT através do programa BYT, sendo atualmente estudante do doutoramento em Ciências do Meio Aquático – Biologia e Ecologia (Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Universidade do Porto). O projeto que está a desenvolver tem como objetivo o isolamento de novos compostos bioativos naturais produzidos por Actinobactérias associadas a esponjas marinhas.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
Estudante de Mestrado

Sílvia Ferreira possui uma licenciatura em Ciências Biomédicas pelo Instituto Universitário de Ciências da Saúde – CESPU. Atualmente, está a concluir o mestrado em Bioquímica em Saúde e encontra-se ativamente envolvida no estágio do seu mestrado no Grupo Biodegradação Microbiana e Bioprospecção. Neste projeto, um dos objetivos é investigar a diversidade taxonómica de actinobactérias provenientes de R. graveolens.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
PhD student

A Sofia Correia é uma aluna de Doutoramento, atualmente a frequentar o programa de Doutoramento em Ciências Biomédicas do Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar da Universidade do Porto. O seu trabalho de investigação é focado na investigação de Actinobactérias, de 2 ambientes pouco explorados, o mar profundo e as grutas, para a descoberta de novos compostos bioativos com relevância farmacológica. A Sofia possui uma licenciatura em Bioquímica (2019, UTAD) e um mestrado em Bioquímica (2021, FCUP-ICBAS, UP).

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana
PhD Student

Sou estudante de doutoramento e o meu interesse de investigação centra-se em: 1.Espécies leguminosas selvagens do Sahara, seu biótopo e sua influência na sua actividade simbiótica. 2.A caracterização dos seus microrganismos simbióticos e a seleção das espécies microbianas mais eficazes a serem investigadas em aplicações biotecnológicas sustentáveis.

Fiz meu bacharelado em Ecologia e Meio Ambiente (2014) e Mestrado em Ciências Ambientais (2016) pela universidade de Kasdi Merbah Ouargla, Argélia.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biodegradação e Bioprospecção Microbiana

Principais publicações

Actinobacteria from Artic and Atlantic deep-sea sediments-biodiversity and bioactive potential.

Ribeiro, I., Antunes, J.T., Alexandrino, D.A.M., Tomasino, M.P., Almeida, E,, Hilário, A., Urbatzka, R., Leão, P., Mucha, A.P., Carvalho, M.F.

2023Frontiers in Microbiology, 14, 862.
Revisiting pesticide pollution: The case of fluorinated pesticides.

Alexandrino, D.A., Almeida, C.M.R., Mucha, A.P., Carvalho, M.F.

2022Environmental Pollution, 292: 118315
Combining Culture-Dependent and Independent Approaches for the Optimization of Epoxiconazole and Fludioxonil-Degrading Bacterial Consortia.

Alexandrino, D.A., Mucha, A.P., Tomasino, M.P., Almeida, C.M.R., Carvalho, M.F

2021Microorganisms, 9: 2109
Atlas of the microbial degradation of fluorinated pesticides.

Alexandrino, D.A., Mucha, A.P., Almeida, C.M.R., Carvalho, M.F.

2021Critical Reviews in Biotechnology
Diversity and Bioactive Potential of Actinobacteria Isolated from a Coastal Marine Sediment in Northern Portugal.

Ribeiro, I., Girão, M., Alexandrino, D.A.M., Ribeiro, T., Santos, C., Pereira, F., Mucha, A.P., Urbatzka, R., Leão, P.N., Carvalho, M.F.

2020Microorganisms, 8: 1691
Microbial degradation of two highly persistent fluorinated fungicides - epoxiconazole and fludioxonil.

Alexandrino, D.A.M., Mucha, A.P., Almeida, C.M.R., Carvalho, M.F.

2020Journal of Hazardous Materials 394: 122545
Actinobacteria isolated from Laminaria ochroleuca: a source of new bioactive compounds.

Girão, M., Ribeiro, I., Ribeiro, T., Azevedo, I.C., Pereira, F., Urbatzka, R., Leão, P.N., Carvalho, M.F.

2019Frontiers in Microbiology.